Краеведческий музей был открыт в феврале 1963 года по инициативе учителей клинских школ. Экспозиция рассказывает о долгой и полной событий истории города.

Постоянная экспозиция Клинского краеведческого музея состоит из четырех разделов: «Клин в древности (XIV–XVIII века)», «Клинский край в XIX веке», «Клинский край в годы Великой Отечественной войны» и «Природа Клинского края». В фондах хранится 25 000 экспонатов — документов, фотографий, книг, предметов искусства, нумизматики, археологии, этнографии. Посетителей больше всего привлекают макет крепости, археологические находки, оружие прошлых веков, предметы купеческого и крестьянского быта, одежда, мебель, орудия труда. Старые почтовые открытки представляют архитектурный облик города в XIX–XX столетиях. Раздел, посвященный Великой Отечественной войне, рассказывает о событиях, происходивших на территории города и района в период Московской битвы.

Для школьников разработана музейная программа «Тайна 82-й версты», занятия состоят из двух частей: первая — экскурсионная, вторая — игровая. Темы занятий —  «Клин в древности», «Клин — город ямщиков», «Археология — любознательным», «От гривны до копейки», «Из истории Николаевской железной дороги». Дети имеют возможность погрузиться в мир купеческой, крестьянской жизни, познакомиться с обычаями, бытом и культурой предков, народными играми и развлечениями. Полная программа музейных занятий рассчитана на два года.