Монастырь основан в 1398 году преподобным Саввой, известным как Звенигородский чудотворец. 
Изначально была построена келья и небольшой деревянный храм Рождества Пресвятой Богородицы. Слава о Звенигородском чудотворце быстро разошлась за пределы села и паломники стали стекаться в обитель. Вскоре были построены новые кельи, появились ограда с воротами.
После предсказания преподобного Саввы о победе князя Юрия Дмитриевича против камских булгар, на устроение монастырю были переданы новые села и деревни.
В 1405 году возводят белокаменный Рождественский собор.
Во время царствования Алексея Михайловича монастырь продолжил свое развитие - его обнесли каменными стенами, возвели новые храмы. Обитель пользовалась почтением у Российских правителей - Елизаветы Петровны, Екатерины II, Николая I, Александра II.
В советское время монастырь был разорен, здесь разместили воинские части, санаторий и музей.
В 1995 году монастырь был возрожден. К 600-летию празднования обители Патриарх Алексий II торжественно перевез в монастырь мощи его основателя Преподобного Саввы.